Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms