Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms