Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNB1P20700 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms