Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM21P19474 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms