Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF3P18847 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF3P18847 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF3P18847 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF3P18847 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms