Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms