Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA2P17301 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms