Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms