Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODC1P11926 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms