Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GLI4P10075 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms