Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms