Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf89P0DMQ9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms