Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms