Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms