Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms