Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSD2O96028 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSD2O96028 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms