Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAK4O96013 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAK4O96013 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAK4O96013 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAK4O96013 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAK4O96013 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms