Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTBP3O95758 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms