Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH1O95406 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms