Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms