Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALUO43852 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CALUO43852 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALUO43852 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALUO43852 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALUO43852 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms