Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR3O43731 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms