Protein–RNA interactions for Protein: O15014

ZNF609, Zinc finger protein 609, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF609O15014 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF609O15014 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms