Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E9PBE3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E9PBE3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E9PBE3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms