Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM220BPB1ANY3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM220BPB1ANY3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms