Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms