Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIPSLA2A3N6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms