Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms