Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms