Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN1Q9ULB1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms