Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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