Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XCL2Q9UBD3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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