Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms