Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms