Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms