Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP1Q9C000 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms