Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
HIGD2AQ9BW72 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HIGD2AQ9BW72 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms