Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms