Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MTA3Q9BTC8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms