Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms