Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRAMP1Q96RY5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms