Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2Q96Q42 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms