Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSNARE1Q96NA8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms