Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms