Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms