Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTP4Q96DX8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTP4Q96DX8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms