Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ULK4Q96C45 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms