Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR2Q969E8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms