Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDAQ92838 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDAQ92838 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDAQ92838 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDAQ92838 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDAQ92838 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDAQ92838 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDAQ92838 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDAQ92838 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms