Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPBP1Q92547 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOPBP1Q92547 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms